Treinamento técnico em sequenciamento de última geração visando a análise da aquisição de totipotência pelo oócito

• Processo: 24/03373-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Reprodução Animal
• Pesquisador responsável: Lawrence Charles Smith
• Beneficiário: Beatriz Faustino Lima Mendonça
• Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/09886-8 - Maturação epigenética do oócito e totipotência: o potencial do oócito e sua relação com o nicho folicular ovariano, AP.SPEC
• Assunto(s): Células-tronco Embriologia Epigenômica Oogênese
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Células tronco | embriologia | epigenética | Oogênese | totipotência | Competência oocitária

Resumo

Os mecanismos epigenéticos que regem a capacidade do gameta feminino (o oócito) de se tornar totipotente estão no centro de muitas questões não respondidas na biologia. A melhor compreensão desses fenômenos básicos oferece uma oportunidade única para desenvolver novas biotecnologias com benefícios de amplo alcance para humanos e animais. No presente projeto temático, lançamos mão de modelos experimentais únicos, com abordagens retrospectivas, análises ômicas e ferramentas de bioinformática de última geração para analisar os mecanismos epigenéticos fundamentais que controlam a aquisição da totipotência pelo oócito. Para que os objetivos almejados sejam cumpridos com sucesso, uma variedade de análises utilizando sequenciamento de última geração (NGS) foi proposta, as quais englobam principalmente a análise do transcriptoma (perfil de mRNAs , lncRNAs e miRNAs) e metiloma. Dada a complexidade e o grande volume de análises NGS consideradas, julgamos ser de grande importância a capacitação de uma pessoa que se responsabilize por esta função, assegurando que as análises sejam realizadas dentro do prazo previsto e com a qualidade técnica necessária. Dentre as funções previstas para essa pessoa incluem-se a extração de DNA e RNA, preparo de bibliotecas de sequenciamento e operação de sequenciadores Illumina. O nosso grupo já dispõe da expertise para o treinamento demandado, devendo o bolsista ser capacitado para o trabalho em diferentes nichos relacionados a área de sequenciamento de ácidos nucléicos.