Estudo transcriptômico de modelo de zebrafish para investigar mecanismos fisiopatológicos da síndrome de xia-gibbs

• Processo: 23/16839-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
• Situação: Interrompido
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Ana Cristina Victorino Krepischi
• Beneficiário: Davi Mendes Campos Fialho
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/02334-0 - Alterações morfologicas durante o inicio do desenvolvimento: validação de modelo de zebrafish para Síndrome de Xia-Gibbs, BE.EP.IC
• Assunto(s): Análise de sequência de RNA Transcriptômica Peixe-zebra
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: RNA-seq | Síndrome de Xia-Gibbs | Transcriptômica | Zebrafish | Transcriptômica

Resumo

A síndrome de Xia-Gibbs (SXG, OMIM #615829) é um transtorno de neurodesenvolvimento causado por variantes patogênicas em heterozigose no gene AHDC1. As principais características clínicas da SGX incluem hipotonia, atraso motor e de fala e deficiência intelectual (DI). A fisiopatologia da SXG ainda não é completamente compreendida, necessitando de estudos funcionais adicionais. Desenvolvemos um modelo de zebrafish (Danio rerio) com uma mutação de perda de função em heterozigose no gene ahdc1, induzida através da técnica CRISPR-Cas9 (denominada ahdc1dsao1 - ZDB-ALT-221025-2 - em zfin.org) (CARVALHO et al. 2023). Estudos transcriptômicos são relevantes para identificação de genes diferencialmente expressos, bem como redes gênicas envolvidas, permitindo a proposição de vias biológicas alteradas em estado patológico. Assim, o presente estudo visa comparar transcriptomas de animais com três genótipos diferentes (heterozigotos, homozigotos e selvagens para mutação em ahdc1) em duas fases diferentes do desenvolvimento. Os objetivos específicos incluem a identificação de transcritos/genes com diferenças significativas entre os genótipos em cada fase, a identificação de vias biológicas enriquecidas, e a resposta a perguntas relacionadas às hipóteses do laboratório, abrangendo o envolvimento do gene ahdc1 em vias de controle de ciclo celular, mielinização, regulação de fome-saciedade, metabolismo energético, além de alterações transcricionais em genes conhecidos de distúrbios genéticos do neurodesenvolvimento. Observações relevantes serão avaliadas por RTqPCR com intuito de validação.