Detecção e caracterização de cepas circulantes de ISKNV (vírus da necrose infecciosa de baço e rim) no Estado de São Paulo

• Processo: 23/17337-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2024
• Data de Término da vigência: 15 de junho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Cláudia Maris Ferreira Mostério
• Beneficiário: Guilherme Nunes Ferrez
• Instituição Sede: Instituto de Pesca. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/13226-1 - Sequenciamento do genoma total do Vírus da Necrose Infecciosa de Baço e Rim (ISKNV), obtido em tilápia (Oreochromis niloticus), cultivada no Estado de São Paulo/Brasil, BE.EP.MS
• Assunto(s): Biologia molecular Reação em cadeia por polimerase (PCR) Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia molecular | Pcr | Sanidade de Organismos Aquáticos | Virologia | Biologia Molecular

Resumo

A ocorrência de doenças emergentes na aquicultura são um tema de preocupação, tanto para a academia quanto para o setor produtivo, dentre essas doenças podemos destacar o vírus da necrose infecciosa de baço e rim (ISKNV). Não se trata de uma zoonose e não é uma doença de notificação compulsória, porém, é potencialmente causadora de grandes perdas nos cultivos, podendo infectar peixes marinhos e dulcícolas. Essa patologia é caracterizada pela necrose esplênica e pela presença de células hipertróficas, que podem ser encontradas principalmente na mucosa intestinal, parênquima renal e hepático. Seus principais sinais clínicos são: anorexia, letargia, rápido movimento opercular; mudança na coloração corporal, exoftalmia e distensão abdominal; algumas formas de diagnóstico incluem exames histopatológicos ou moleculares. O objetivo desse trabalho é rastrear a ocorrência de ISKNV em quatro regiões hidrográficas do do Estado de São Paulo e sequenciar o genoma total das cepas circulantes encontradas. Até o momento foram amostrados aleatoriamente alevinos da população de quatro tilapiculturas, em três distintas regiões hidrográficas no Estado de São Paulo (n=567). Os animais foram insensibilizados utilizando eugenol seguido de secção medular, após isso foi realizada a necropsia e a retirada dos órgãos alvo (baço e rim). Foram feitos pools com órgãos de três animais e realizada a extração de DNA total das amostras seguido de PCR convencional amplificando um fragmento de 777 pb do gene MCP (Major Capsid Protein). Para o controle endógeno de qualidade das extrações de DNA serão utilizados primers correspondentes a ²-actina, indicando a viabilidade do material genético presente nas amostras. As amostras ISKNV positivas seguirão para sequenciamento através do método Sanger para comparação do fragmento obtido com as sequências de referência depositadas no banco de dados Genbank. Posteriormente serão sequenciadas todas as amostras positivas remanescentes e realizadas análises para avaliação de similaridade, por meio de avaliação de regiões polimórficas. Também serão enviadas amostras para o sequenciamento total do genoma viral que será realizado na Washington State University, Pullman, US. Os resultados obtidos auxiliarão no avanço do conhecimento da ocorrência do ISKNV pelo Estado de São Paulo.