Identificação in silico de genes associados ao sistema CRISPR-Cas na microbiota humana intestinal de obesos

• Processo: 24/05797-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Leandro Nascimento Lemos
• Beneficiário: Barbara da Paixão Perez Rodrigues
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Ecologia microbiana Microbioma gastrointestinal Obesidade Metagenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Ecologia microbiana | Illumina | microbiota intestinal | obesidade | Metagenômica

Resumo

A disbiose intestinal é considerada um dos fatores envolvidos em doenças complexas, tais como a obesidade humana. Estudos recentes baseados em sequenciamento massivo de DNA indicam que pacientes obesos apresentam uma menor diversidade microbiana. No entanto, muitos aspectos funcionais das comunidades microbianas ainda foram pouco explorados, tais como a diversidade de genes associados ao sistema CRISPR-Cas, sendo um sistema de defesa microbiano contra bacteriófagos que armazena informações de históricos de infecções. Neste contexto, o objetivo geral deste projeto será identificar e quantificar os genes associados ao sistema CRISPR presentes na microbiota intestinal de humanos obesos e comparar com humanos não-obesos. O foco analítico deste projeto será baseado em análises comparativas \textit{in silico} a partir de bancos de dados públicos de sequências genéticas e de genomas reconstruídos a partir de metagenomas. Espera-se identificar a orientação do arranjo de CRISPR, a anotação de proteínas cas e a classificação de seus diferentes subtipos. Com isso, poderemos verificar se a microbiota de obesos apresenta uma maior ou menor diversidade de CRISPR comparada com aquela presente em não-obesos, bem como indicar potenciais novas biotecnologias de edição de genomas. Esse projeto também irá contribuir com a formação de recursos humanos em Ciência de Dados, Microbiologia e Bioinformática, no contexto interdisciplinar da Ilum (Escola de Ciência) do Centro de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM).