Desenvolvimento de metodologias para enriquecimento de proteínas em biópsias líquidas utilizando nanopartículas magnéticas funcionalizadas.

• Processo: 23/18374-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2026
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Adriana Franco Paes Leme
• Beneficiário: Isamara Rodrigues Barbosa
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/18496-6 - O papel do álcool na transformação de células orais mediada por vesículas extracelulares, AP.TEM
• Assunto(s): Neoplasias bucais Espectrometria de massas Nanotecnologia Proteômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cancer oral | Espectrometria de massas | Nanotecnologia | proteômica | Proteômica

Resumo

A proteômica permite analisar em larga escala o conteúdo global de proteínas presentes em diferentes sistemas biológicos por meio da identificação e quantificação das mesmas, além de suas modificações pós-traducionais (PTMs). Estudos da literatura, incluindo do nosso grupo, têm demonstrado que análises baseadas em ômicas em diversos biofluidos permitem a compreensão das alterações dessas biomoléculas e suas possíveis associações com processos fisiológicos e patológicos. Embora a sensibilidadedas técnicas e equipamentos tem sido implementados ao longo dos anos, ainda há uma limitação de cobertura de proteomas em função da grande faixa dinâmica de concentração. Diante disso, esse projeto propõe desenvolver metodologias utilizando nanopartículas magnéticas (NPMs) funcionalizadas para ampliar a cobertura do proteoma em termos de número de proteínas identificadas e quantificados, como também de cobertura de sequências das proteínas, minimizando a alta faixa dinâmica de concentração de proteínas. Para isso, três tipos de NPMs, além das comerciais MagResyn® SAX e Sera-MagTM SpeedBeads, serão sintetizadas in house, funcionalizadas com grupo carboxila, fosfatidilcolina e polietilenoglicol ecaracterizadas por microscopia eletrônica de varredura, espectroscopia de fotoelétrons de raios X, difração de raios-X, potencial zeta e espectroscopia no infravermelho. Na etapa subsequente, as NPMs serão incubadas com amostras de saliva, plasma e fluido lacrimal de indivíduos saudáveis (n=6) para a avaliação do "efeito corona" e as proteínas identificadas e quantificadas por proteômica baseada em espectrometria de massas e os dados analisados por diferentes estratégias de bioinformática. Os resultados desse estudo ampliarão o conhecimento de proteomas complexos de biofluidos, prospectando as NPMs selecionadaspara etapas futuras aplicadas ao enriquecimento de proteomas de biofluidos de pacientes, aumentando a capacidade de seleção de proteínas candidatas à marcadores.