Barcoding e metabarcoding de espécies recifais das ilhas costeiras do litoral paulista

• Processo: 24/09214-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
• Pesquisador responsável: Rodrigo Rodrigues Domingues
• Beneficiário: Eduarda Valério de Jesus
• Supervisor: Naiara Guimaraes Sales
• Instituição Sede: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Salford, Manchester, Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 22/14631-1 - Multilocus DNA barcode de espécies marinhas não representadas em banco de dados de sequências: subsídios para o DNA metabarcoding na costa de São Paulo, BP.IC
• Assunto(s): Biodiversidade Ecologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biodiversidade marinha | Ecologia molecular | genética marinha | Oceanografia | Oceanografia, Genética da conservação, Ecologia molecular

Resumo

Poríferos e Cnidários são dois filos que representam organismos fundamentais para o ecossistema marinho. Os poríferos desempenham um papel ecológico crucial devido ao seu sistema de filtração que absorve carbono, fósforo e nitrogênio do meio ambiente, influenciando a qualidade da água. Por outro lado, os cnidários apresentam uma elevada diversidade de espécies com um papel importante na manutenção do equilíbrio ecológico, principalmente devido aos recifes de corais, um importante ecossistema com elevada densidade e diversidade de espécies no oceano, contribuindo para o aumento das relações ecológicas entre os organismos. Portanto, o monitoramento contínuo desses filos é necessário para manter o equilíbrio ecológico e garantir um ecossistema saudável. Atualmente, diversas abordagens são empregadas para monitorar a biodiversidade marinha, incluindo o biomonitoramento 2.0. Este método utiliza DNA ambiental (eDNA) juntamente com a técnica de metabarcoding, permitindo a identificação de múltiplas espécies simultaneamente através de sequenciamento e comparação com sequências de bases de bancos de dados genômicos. Para isso, é necessário um banco de dados de referência de sequência atualizado que cubra de forma abrangente uma ampla gama de espécies na área de estudo. Assim, este projeto BEPE tem dois objetivos: (i) sequenciar o barcode de espécies não representadas na base de dados de referência, (ii) ganhar experiência em trabalhos de laboratório e a preparação e sequenciamento de bibliotecas de metabarcoding. Após esse período no exterior, será possível desenvolver e enriquecer bancos de dados por meio de barcoding de amostras de tecidos de espécies do litoral paulista, consequentemente, potencializando a técnica de biomonitoramento 2.0 para avançar no monitoramento de espécies dos filos em estudo.