Identificação e caracterização de off-targets e variações estruturais em eventos de milho

• Processo: 23/10920-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Paulo Arruda
• Beneficiário: Maria Helena Faustinoni Bruno
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Biotecnologia Técnicas de genotipagem Milho
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biotecnologia | Genotipagem | milho | Off Target | Genética

Resumo

A tecnologia CRISPR/Cas possibilitou a edição dos genomas e já foi utilizada para fins de melhoramento genético em diversas culturas de interesse agrícola. No entanto, eventos gerados através de tecnologia podem apresentar mutações no alvo (on target) e fora do alvo (off-target) e até alterações estruturais. Alterações genéticas podem alterar o perfil de expressão de um organismo, desta forma se torna fundamental entender o que essas variações no genoma causadas pela edição gênica podem ocasionar no perfil de expressão dos genes e compreender a ocorrência de tais eventos. O milho é uma das plantas mais cultivadas do mundo e tem grande importância econômica principalmente na alimentação humana e animal. Com as constantes alterações climáticas, eventos de seca severa estão se tornando mais frequentes e se torna necessário o desenvolvimento de cultivares que respondam de maneira mais eficiente a essas condições. Estudos anteriores relataram o papel do gene Oxysterol-binding protein-related protein (ORP) como um candidato na tolerância a seca. Em milho, este mesmo gene foi identificado como associado a tolerância à seca em estudos de GWAS realizados pelo nosso grupo (dados ainda não publicados), evidenciando a importância deste gene na resposta ao estresse hídrico. Este presente trabalho tem como objetivo principal caracterizar variações estruturais e regiões off-targets de eventos de milho gerados por CRISPR/Cas, usando como alvo o gene ORP e realizar a caracterização funcional deste gene e sua contribuição na resposta ao estresse hídrico.