Elaboração de rotinas e preparação de dados de RNA-Seq para análise de clusterização e alinhamento

• Processo: 24/14779-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
• Pesquisador responsável: Alexandre Keiji Tashima
• Beneficiário: Pedro Andrade Pereira
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/05975-6 - Anticorpos contra o SARS-CoV-2 do plasma de vacinados: dinâmica da resposta humoral, sequenciamento, expressão e efetividade dos recombinantes para terapia e diagnóstico, AP.R
• Assunto(s): Anticorpos COVID-19 Proteômica Análise de sequência de RNA Vacinação Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anticorpos | Covid-19 | proteômica | RNA-seq | Vacinação | Virologia

Resumo

O bolsista TT-1 aprenderá e contribuirá com o desenvolvimento de ferramentas de bioinformática direcionadas à análise de dados de sequenciamento de RNA, obtidas principalmente pela plataforma MinION Mk1C (Oxford Nanopore Technologies). O bolsista contribuirá com a instalação de ferramentas no ambiente Unix/Linux, voltadas à análise de sequências, e elaborará rotinas para a clusterização e alinhamento das sequências.