PanCancer: desenvolvimento de um painel genético avançado para diagnóstico e monitoramento de diversos tipos de câncer em cães

• Processo: 24/16026-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Fixação de Jovens Doutores
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2025
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Heidge Fukumasu
• Beneficiário: Osiel Silva Gonçalves
• Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 24/02168-0 - PanCancer: desenvolvimento de um painel genético avançado para diagnóstico e monitoramento de diversos tipos de câncer em cães, AP.R
• Assunto(s): Biologia computacional Oncologia veterinária
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Mutações causais | Oncologia Veterinária | Teste diagnóstico | teste prognóstico | Bionformática aplicada

Resumo

Em medicina veterinária a análise histopatológica ainda é o exame mais utilizado no diagnóstico de neoplasias em cães. Entretanto, persistem desafios significativos, tanto na determinação da origem das células neoplásicas quanto no acompanhamento do paciente oncológico, devido as limitações dessa técnica. Assim, o desenvolvimento de métodos diagnósticos mais ágeis, eficientes e menos invasivos, adequados para incorporação na rotina clínica são de suma importância. Uma abordagem "pan-câncer" envolve analisar os genes mais frequentemente mutados e outras anormalidades genéticas comuns a maioria dos cânceres, independente da origem tumoral. Assim, o objetivo é desenvolver um painel de sequenciamento genético para diagnóstico preciso e monitoramento de diferentes cânceres caninos através da biópsia líquida. Para o desenvolvimento do painel serão selecionados os principais genes mutados e anormalidades genéticas frequentemente associadas ao câncer em cães a partir de revisão sistemática da literatura e análise comparativa. O painel será confeccionado para amplificação destas regiões e posterior sequenciamento no sistema Ion Genestudio S5 plus. Análises de bioinformática serão realizadas para detecção de variação no número de cópias e detecção de potenciais mutações causais. A validação inicial do painel será realizada em amostras neoplásicas obtidas de tecido tumoral fresco ou congelado e amostras de biopsia líquida de diferentes tipos tumorais para validação do painel pertencentes ao banco de amostras do LOCT-USP. Em etapa futura, será realizado experimento prospectivo para validação do uso do painel para monitoramento de doença residual mínima por biópsia líquida.