Integração de dados variantes de nucleotídeos únicos, ancestralidade genética, e RNA-seq de núcleos únicos do córtex pré-frontal de pacientes com esquizofrenia

• Processo: 24/18987-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Síntia Iole Nogueira Belangero
• Beneficiário: Gustavo Satoru Kajitani
• Supervisor: Konstantin Khodosevich
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Copenhagen, Dinamarca
• Vinculado à bolsa: 22/14055-0 - Avaliação do potencial prognóstico de MicroRNAs no desenvolvimento de epilepsia pós trauma cranioencefálico, BP.PD
• Assunto(s): Esquizofrenia Genética psiquiátrica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ancestralidade genética | esquizofrenia | RNA-seq de núcleos únicos | transcriptoma de células únicas | Variantes de nucleotídeo único | Genética psiquiátrica

Resumo

A esquizofrenia é um dos distúrbios psiquiátricos mais bem caracterizados, e seus pacientes apresentam sintomas como psicose, comprometimento cognitivo e disfunção social. Ela possui um componente genético proeminente, sendo sua herdabilidade estimada em cerca de 70%. Apesar de extensas pesquisas genômicas e transcriptômicas, apenas alguns genes foram consistentemente associados à esquizofrenia. A variabilidade nos resultados pode ser atribuída a fatores como o desenho do estudo, as manifestações dos sintomas, a composição do tipo celular dos tecidos estudados, além de variações ambientais e genéticas, incluindo diferenças na ancestralidade genética. Para lidar com esses fatores, este projeto tem como objetivo realizar análises integrativas utilizando RNA-Seq de núcleos únicos (snRNA-seq) de núcleos neuronais do córtex pré-frontal, obtidos a partir de amostras post-mortem de indivíduos que tiveram esquizofrenia e indivíduos controles. Essas amostras estão sendo obtidas de pacientes com diversas diferentes ancestralidades genéticas. Usando snRNA-seq, iremos identificar a composição dos tipos celulares e as alterações na expressão gênica específicas na esquizofrenia. Além disso, identificaremos variantes genéticas a partir dos dados de snRNA-seq para obter variantes de nucleotídeo único (SNVs) de cada amostra, possibilitando a reconstrução dos dados genéticos, que serão usados para identificar a ancestralidade das amostras e associar as SNVs à expressão gênica específica da esquizofrenia em subtipos neuronais e aos sintomas específicos dos pacientes. Esta análise integrativa e multidimensional pode melhor elucidar a etiologia molecular dos comprometimentos funcionais no cérebro na esquizofrenia, e, portanto, em sintomas específicos de distúrbios psiquiátricos, potencialmente facilitando o avanço de diagnósticos personalizados e da descoberta de medicamentos para essas doenças.