Montagem e análise comparativa de genomas de duas variedades crioulas de milho.

• Processo: 24/23222-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Isabel Rodrigues Gerhardt
• Beneficiário: Fernanda Back de Souza
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Empresa: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG)
• Vinculado ao auxílio: 16/23218-0 - Centro de Pesquisa em Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas, AP.PCPE
• Assunto(s): Mudança climática Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformatic | Climate Change | Genomics | Plant biotechnology | Biotecnologia Vegetal/ Biologia Vegetal

Resumo

Certas populações de espécies cultivadas, ao passarem por um processo de diferenciação genética devido à adaptação acondições ambientais específicas, influenciadas pelas práticas de manejo adotadas por comunidades tradicionais oupequenos produtores, resultam no que se denomina variedades crioulas, possuindo um conjunto de genes e alelos que nãoestão presentes nas cultivares agrícolas. A riqueza de diversidade genética observada nas variedades crioulas é uma dasprincipais razões do valor inestimável que esses recursos genéticos representam e do crescente interesse no seu uso emprogramas de pré-melhoramento e melhoramento agrícola.Esta proposta tem como objetivo explorar essas características, ao sequenciar os genomas de duas variedades crioulas demilho, depositadas no Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de milho da Embrapa. Depois da montagem e anotação dosgenomas, os mesmos serão comparados com os de variedades de milho, com o objetivo de identificar elementos genômicosque podem contribuir para adaptações aos estresses decorrentes das mudanças climáticas, fornecendo um banco de dadospara futuras pesquisas em melhoramento genético e fisiologia vegetal. Na primeira fase do projeto será realizada a montageme anotação dos genomas das variedades crioulas utilizando tecnologias de sequenciamento de nova geração, combinadascom abordagens bioinformáticas, gerando genomas completos e anotados. Esses dados servirão como uma base robustapara análises subsequentes, permitindo a identificação de genes relacionados à resposta a múltiplos estresses. Na segundafase, serão realizadas análises de genômica comparativa entre diferentes genomas já sequenciados de milho e as duasvariedades crioulas. O presente trabalho amplia o trabalho anterior do grupo. Essas análises incluirão a identificação deregiões genômicas conservadas e divergentes, genes ortólogos e parálogos, expansão e contração de famílias gênicas bemcomo elementos regulatórios que possam estar associados a estratégias adaptativas dos diferentes genótipos de milho,contribuindo para o desenvolvimento de estratégias de melhoramento genético e biotecnologia vegetal, visando a produçãode culturas mais resistentes ao estresse ambiental.