Um estudo de vacinologia de sistemas entre humanos e animais-modelo para medicina translacional

• Processo: 25/01063-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Gustavo Cabral de Miranda
• Beneficiário: Wasim Aluísio Prates Syed
• Supervisor: Thomas Hagan
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Cincinnati Children's Hospital Medical Center, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 21/08468-8 - Desenvolvimento de vacinas baseadas em VLPs contra SARS-CoV-2 e outros Coronavírus humanos, BP.DD
• Assunto(s): Aprendizado computacional Biologia de sistemas Transcriptômica Vacinas Ciências ômicas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aprendizado de Máquina | biologia de sistemas | Imunotranscriptômica | Transcriptômica | Vacinas | Ômicas

Resumo

As vacinas revolucionaram a medicina moderna ao proteger indivíduos por meio de respostas imunes. No entanto, as diferenças nos mecanismos imunológicos entre as espécies, particularmente entre humanos e modelos animais, representam desafios na tradução de descobertas pré-clínicas para aplicações humanas. Utilizando dados de RNA-seq e microarray de diferentes estudos, este projeto visa analisar a conexão nos padrões de expressão gênica induzidos por vacinas entre humanos e camundongos. Com o uso do COVID-19 Vaccination Atlas e do 13 Vaccines Atlas, serão identificadas vias imunes conservadas e específicas de cada espécie por meio de análise de expressão diferencial, meta-análise e modelagem com aprendizado de máquina para traduzir respostas imunes interespécies. Espera-se identificar biomarcadores para a eficácia das vacinas, destacar as limitações de tradução dos modelos de camundongos e fornecer subsídios para o desenho de vacinas de próxima geração. Os resultados serão integrados em uma plataforma interativa para análise comparativa, oferecendo insights sobre os mecanismos imunes na vacinação e orientando o desenvolvimento de vacinas para populações diversas.