Reconhecimento e caracterização de Cnidaria dulciaquícolas com a utilização de DNA ambiental (eDNA)

• Processo: 24/18310-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2028
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Zoologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Sérgio Nascimento Stampar
• Beneficiário: Luana Maria Deoclécio da Silva
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/16193-1 - Biologia, ecologia e sistemática de Anêmonas-do-mar lato sensu (Anthozoa, Actiniaria e Ceriantharia) no Oceano Atlântico, AP.BTA.R
• Assunto(s): Água doce DNA ambiental Hidrozoários Identificação Sequenciamento de nova geração Genética molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Água doce | DNA ambiental | Hydrozoa | Identificacao | Metabarcoding | sequenciamento de nova geração | Genética molecular

Resumo

O estudo sobre a diversidade de cnidários de água doce (Hydrozoa) no Brasil ainda é incipiente. Existe uma considerável lacuna de conhecimentos sobre a presença e distribuição desses organismos, principalmente em termos de evidências moleculares sólidas. Nos últimos anos, o uso de DNA ambiental (do inglês, environmental DNA - eDNA) pela abordagem de metabarcoding emergiu como uma ferramenta promissora para caracterizar e monitorar comunidades biológicas, principalmente em ambientes aquáticos. Entretanto, até o momento, não há relados do uso dessa metodologia para avaliar os hidrozoários de água doce. Diante disso, o objetivo principal do atual projeto é identificar e caracterizar filogeneticamente a composição de Cnidaria dulciaquícolas no Brasil, através do eDNA metabarcoding associado ao sequenciamento de nova geração. Com esse propósito, amostras de água serão coletadas ao longo das doze Regiões Hidrográficas do Brasil e encaminhadas ao laboratório para serem filtradas. O DNA presente nos filtros de membrana será extraído e sequências parciais do gene mitocondrial COI (citocromo c oxidase subunidade 1) serão amplificadas por PCR (Polymerase Chain Reaction) utilizando um conjunto de primers universais para invertebrados. Posteriormente, os amplicons serão encaminhados para um serviço terceirizado onde será realizada a preparação das bibliotecas e o sequenciamento na plataforma Illumina Miseq. As análises de bioinformática e a construção das árvores filogenéticas serão realizadas no software Geneious Prime. Os resultados desse trabalho devem contribuir para um maior entendimento da diversidade de hidrozoários dulciaquicolas no Brasil, assim como, aumentar a composição dos dados genéticos e de ocorrência nas plataformas públicas.