Integração de dados de transcriptoma e acessibilidade de cromatina para reconstrução da rede cis-reguladora do desenvolvimento de ovários de abelhas

• Processo: 24/22812-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2025
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Flávia Cristina de Paula Freitas
• Beneficiário: Sarah Calado Galvão de Melo
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/13719-7 - Assinaturas genômicas da diversidade e da plasticidade no desenvolvimento fenotípico, AP.JP
• Assunto(s): Abelhas Ovário Plasticidade Análise de sequência de RNA Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Abelhas | ATAC-seq | Operárias | ovários | Plasticidade | RNA-seq | Bioinformática

Resumo

O desenvolvimento das abelhas oferece uma oportunidade única de compreender os mecanismos da plasticidade fenotípica em que um mesmo genoma é capaz de orientar a formação de uma rainha fértil ou de uma operária incapaz de se acasalar. A divisão do trabalho reprodutivo entre rainha e operária é uma das características das abelhas eussociais, como as abelhas melíferas (Apini) e as abelhas sem ferrão (Meliponini). As operárias adultas das abelhas melíferas possuem ovários inativos, mas que possuem o potencial de se tornarem ativos em condições especiais. Já as operárias das abelhas sem ferrão apresentam grande diversidade na capacidade reprodutiva que varia desde a esterilidade permanente (Frieseomelitta varia) até a completa ativação dos ovários (Melipona quadrifasciata). este projeto tem como objetivo compreender as bases moleculares da formação dos ovários das operárias de Apis mellifera que guardam o potencial de se tornarem ativos na fase adulta. Para isto, o transcriptoma (RNA-seq) e as regiões de cromatina acessíveis dos ovários de larvas operárias serão caracterizados. As regiões de cromatina acessível serão submetidas a uma busca por elementos de ligação de fatores de transcrição. A integração de diferentes níveis de regulação, como sequências genômicas reguladoras (obtidas através do ATAC-seq) e o transcriptoma (RNA-seq) permitirá a reconstrução da rede reguladora da formação dos ovários de larvas operárias