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Sistemática e arquitetura genômica de Piculus flavigula (Boddaert, 1783) (Aves: Picidae)

Processo: 24/18369-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2025
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2026
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia
Pesquisador responsável:Vagner Aparecido Cavarzere Junior
Beneficiário:Enrico Lopes Breviglieri
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):25/07032-2 - Sistemática e arquitetura genômica de Piculus flavigula (Boddaert, 1783) (Aves: Picidae), BE.EP.MS
Assunto(s):Bioacústica   Evolução   Genômica   Aprendizado computacional   Ornitologia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bioacústica | Evolução | Genômica | machine learning | segmentação de cores | Taxonomia morfológica | Ornitologia

Resumo

Revisões taxonômicas de espécies com históricos nomenclaturais complexos são fundamentais para o estudo e conservação da biodiversidade. Piculus flavigula inclui três subespécies: P. f. flavigula, P. f. magnus e P. f. erythropis, todas diagnosticáveis e distribuídas alopatricamente. As duas primeiras ocorrem ao norte e ao sul do rio Amazonas, respectivamente, enquanto a última é endêmica da Mata Atlântica, onde há três populações alopátricas: uma no sul-sudeste, outra no corredor central (entre o norte do Rio de Janeiro e o sul da Bahia), e uma restrita ao Centro de Endemismo Pernambuco. Este projeto realizará a revisão taxonômica do complexo P. flavigula com base em evidência genéticas, morfológicas e vocais. A fim de medir o nível de isolamento reprodutivo entre táxons, o genoma completo de um indivíduo de P. flavigula será sequenciado, assim como, a uma cobertura de 20X, outros 20 indivíduos provenientes de museus, representando os três táxons do complexo. Será obtida a morfometria e feita a codificação da coloração da plumagem de espécimes de museus sob o escrutínio do modelo visual das aves. Serão analisadas vocalizações presentes em bancos de dados vocais por meio de embeddings de modelo pré-treinado de rede neural e classificação das vocalizações com modelo supervisionado (Support Vector Machine) na busca de informações taxonômicas. Para análise dos dados morfométricos e bioacústicos será feita Análise Multivariada de Variância para determinar diferenças entre populações, bem como Análise Linear Discriminante para identificar visualmente as variáveis que influenciam em diferenciações. Com a caracterização da variação genética na paisagem genômica combinada aos resultados referentes às estruturas morfológica e vocal, espera-se identificar quantas linhagens compõem o complexo P. flavigula, e determinar os seus status de ameaça.

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