SERBP1 no contexto de retrotransposição: estudo da interação com L1 e seu impacto funcional

• Processo: 24/22059-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Jörg Kobarg
• Beneficiário: Julia Leite Cordeiro de Souza
• Supervisor: John Lacava
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Rockefeller University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 22/04962-0 - Estudos da oncoproteína SERBP1: Análise do transcriptoma, proteoma e funções da forma selvagem e de mutações pontuais encontradas em câncer, BP.DR
• Assunto(s): Neoplasias Retroelementos Sinalização
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | L1 | retrotransposon | Serbp1 | Sinalização | mecanismos de sinalização, câncer

Resumo

Retrotransposons são elementos genéticos móveis que copiam suas sequências e as inserem em novos locais genômicos por meio de intermediários de RNA usando um mecanismo de "copiar e colar" chamado retrotransposição. O Long-Interpersed Element-1 (L1) é o único retrotransposon funcional autônomo em humanos. Quando L1 é transcrito, duas proteínas são traduzidas: ORF1p e ORF2p, no citosol elas podem formar um complexo de ribonucleoproteína que pode se associar a outras moléculas, como proteínas de ligação de RNA.Neste contexto, SERBP1, uma proteína de ligação de mRNA, está associada a muitos eventos celulares, como remodelação da cromatina, estabilidade de mRNA e depuração de grânulos de estresse. Dados anteriores revelaram uma associação entre L1 e SERBP1 e seu RNA, e uma possível colocalização em grânulos. No entanto, essas interações ainda não foram bem esclarecidas e controversas. Além disso, esses estudos anteriores consideraram apenas expressões ectópicas para analisar a interação entre SERBP1 e L1 e seus transcritos.No presente projeto, propomos investigar o envolvimento de SERBP1 e retrotransposição analisando interações endógenas entre SERBP1 e L1 a nível de proteína por meio de IP-MS e a nível de transcrição por meio de RIP-seq em duas linhagens de células cancerígenas. Considerando que tanto SERBP1 quanto ORF1p são expressos em grânulos, analisaremos a colocalização endógena deles e outros marcadores de grânulos por meio de ensaios de imunofluorescência. Após realizar esses experimentos, seremos capazes de determinar como essas moléculas estão relacionadas e determinar os ensaios funcionais adequados para elucidar o papel biológico de SERBP1 e L1.