Expressão genética de fungos em culturas de formigas e elementos transponíveis

• Processo: 24/20805-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Pepijn Wilhelmus Kooij
• Beneficiário: Stéfany Renata Rodrigues
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/22329-0 - O papel da assexualidade na estabilidade dos mutualismos, AP.JP
• Assunto(s): Fungos Expressão gênica Micologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Fungi | fungus-growing ants | gene expression | methylation | Minion | Transcriptomics | Micologia

Resumo

O terceiro objetivo do Projeto "O papel da assexualidade na estabilidade do mutualismo" é investigar o papel que as formigas cultivadoras de fungos têm na epigenética de sua cultura fúngica. As cultivares de formigas attine demonstraram crescer cogumelos quando as colônias colapsam (Fisher et al., 1994; Mueller, 2002), sugerindo que as formigas suprimem a formação de basidiomas. Portanto, se as formigas suprimem a sexualidade fúngica, elas irão manipular a expressão gênica de sua cultura por meio da alteração de fatores epigenéticos, bem como da arquitetura genômica para manter a assexualidade. Este projeto analisará como as formigas influenciam a expressão gênica fúngica através da transcriptômica de culturas fúngicas com e sem formigas. Além disso, a presença e localização de elementos transponíveis (ETs) dentro dos genomas serão analisadas. O genoma e o transcriptoma serão obtidos utilizando a técnica de leitura longa da Oxford Nanopore Technologies MinION. Devido à natureza dessa técnica de sequenciamento, dados sobre padrões de metilação podem ser extraídos (Simpson et al., 2017). Este projeto contribuirá para a compreensão da coevolução desse mutualismo enigmático e seu efeito na arquitetura genômica, bem como para a evolução dos mutualismos em geral.