Análise transcriptômica global da interação tripartite entre X. citri, um de seus bacteriófagos líticos e o hospedeiro citros

• Processo: 25/03250-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Henrique Ferreira
• Beneficiário: Caio Felipe Cavicchia Zamunér
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Cancro (doença de planta) Expressão gênica Análise de sequência de RNA Fitopatologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: citrus canker | gene expression | Phage | RNA-seq | Transcriptomic | fitopatologia

Resumo

A citricultura é umas das atividades agriculturais mais importantes no Brasil, onde o estado de São Paulo mantém sua posição como o maior produtor de laranja doce no mundo. Dentre várias ameaças que afetam a produção de citros, o cancro cítrico, causado pela bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri) é uma fitopatologia não tratável que causa significativas perdas econômicas. O manejo é realizado majoritariamente por aplicações frequentes de bactericidas baseados em cobre, que já foram associados ao desenvolvimento de linhagens resistentes e danos ao meio ambiente. Os bacteriófagos, como predadores naturais das bactérias, têm sido utilizados como um biocontrole alternativo em vários outros cultivares de plantas de interesse econômico. Entretanto, pouco ainda é conhecido sobre como se dá a interação entre o hospedeiro e o fago, especialmente no caso de X. citri. Durante o processo de infecção, os fagos podem desligar uma série de vias metabólicas em seu hospedeiro, por fim tomando o controle da maquinária replicativa da célula para produzir novos vírions. Acessar o panorama transcricional dessa relação pode trazer novos conhecimentos sobre novos mecanismos de defesa utilizados por X. citri, sobre o desligamento de fatores de virulência e outras alterações metabólicas. Com isso, pretendemos estudar este panorama transcrional utilizando RNA-seq aplicados a experimentos in vitro e também in planta, afim de capturar a inter-relação entre fago-bactéria e fago-bactéria-planta durante o desenvolvimento do cancro cítrico. Nosso objetivo é identificar possíveis mudanças na virulência bacteriana e nas respostas imunes inatas da planta durante a infecção de X. citri infectadas por bacteriófagos.