Implementação de infraestrutura computacional para criomicroscopia eletrônica.

• Processo: 25/05809-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah
• Beneficiário: Gabriel Umaji Oka
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Biologia estrutural Microbiologia molecular Processamento de dados Processamento de imagens
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Estrutural | Criomicroscopia eletrônica | Microbiologia Molecular | Processamento de Dados | Processamento de imagens | Sistema de secreção do tipo IV | Biologia Estrutural

Resumo

A infraestrutura computacional necessária para o cálculo da estrutura de proteínas com base na análise de conjuntos de imagens obtidas usando microscopia crioeletrônica (CryoEM) é altamente exigente. Essa análise requer enormes quantidades de espaço em disco e memória do computador. Neste projeto, configuraremos essa infraestrutura de computador, implementaremos a análise de software de conjuntos de dados CryoEM para reconstrução de partículas únicas e auxiliaremos os alunos de doutorado e pós-doutorado do CEPID no uso do CryoEM para obter informações de estrutura sobre as proteínas e complexos de seu interesse.