Diversidade das sequências regulatórias previstas de swan, nox e spxB entre as cepas de S. sanguinis.

• Processo: 25/09154-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 08 de setembro de 2025
• Data de Término da vigência: 13 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Odontologia
• Pesquisador responsável: Renata de Oliveira Mattos Graner
• Beneficiário: Emanoeli Daniel Bessa
• Supervisor: Tsute Chen
• Instituição Sede: Faculdade de Odontologia de Piracicaba (FOP). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Forsyth Institute, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 23/16788-8 - Análise dos efeitos dos genes spxB, swan e nox de Streptococcus sanguinis na produção de NETs por neutrófilos humanos, BP.IC
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bloodstream infections | NETosis | Streptoccus sanguinis | Transcriptional regulators | Two-component systems (TCS) | Virulence Genes | Microbiologia e Imunologia Oral

Resumo

Streptococcus sanguinis é uma bactéria comensal da cavidade oral frequentemente associada à endocardite infecciosa (EI) e à aterosclerose. Essa espécie possui uma capacidade particular de persistir na corrente sanguínea e, eventualmente, infectar tecidos cardiovasculares. Nenhum conjunto específico de genes de virulência foi detectado em cepas associadas à infecção cardiovascular em comparação com cepas comensais orais. Por outro lado, parece que as cepas de S. sanguinis dependem da expressão dos genes swan, nox e spxB para evadir a imunidade sanguínea mediada pelo sistema complemento e pelos neutrófilos (PMNs). No entanto, os mecanismos que controlam a atividade desses genes ainda precisam ser elucidados. O genoma da cepa de referência SK36 abriga genes que codificam quatorze sistemas regulatórios transcripcionais do tipo dois componentes (TCS), os quais são sistemas-chave na modulação dos transcriptomas bacterianos em resposta a estímulos ambientais. Poucos desses TCS foram investigados até o momento, e seus papéis na regulação da transcrição de swan, nox e spxB ainda permanecem a ser explorados. O objetivo deste projeto é aplicar análises in silico das regiões regulatórias dos genes swan, nox e spxB em cepas de S. sanguinis para identificar seus potenciais reguladores. Serão utilizadas ferramentas de bioinformática e aprendizado de máquina profundo (ferramenta de rede neural recorrente "ORAKLE") para prever a regulação dos genes swan, nox e spxB por diferentes TCS. A conservação das regiões regulatórias identificadas será então avaliada por meio da identificação de motivos de ligação conservados de reguladores TCS específicos e por alinhamento múltiplo das sequências das regiões promotoras dos genes swan, nox e spxB. Os achados deste estudo podem lançar luz sobre os mecanismos que regulam a expressão desses genes de virulência e, assim, sobre os mecanismos que fundamentam os diferentes comportamentos de S. sanguinis como comensal ou patógeno. (AU)