Implementação da Preparação de Biblioteca de DNA de Cadeia Simples para Acessar a História Populacional das Sociedades Marítimas Pré-Coloniais do Estado de São Paulo

• Processo: 25/04976-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 20 de agosto de 2025
• Data de Término da vigência: 19 de fevereiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Humanas - Arqueologia - Arqueologia Pré-histórica
• Pesquisador responsável: André Menezes Strauss
• Beneficiário: Carolina Eva Padilha
• Supervisor: Kathrin Naegele
• Instituição Sede: Museu de Arqueologia e Etnologia (MAE). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Max-Planck-Institut Für Evolutionäre Anthropologie, Alemanha
• Vinculado à bolsa: 23/16983-5 - História populacional das sociedades marítimas pré-coloniais do Estado de São Paulo: análise arqueogenética do Sambaqui Piaçaguera, BP.MS
• Assunto(s): Sambaquis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ancient DNA | library preparation | sambaqui | Arqueogenética

Resumo

Sambaquis são compostos pela acumulação intencional de conchas de moluscos e fauna marinha ao longo de centenas ou milhares de anos, sendo encontrados de forma intermitente ao longo da costa brasileira. Essas construções marcam a presença humana nas regiões costeiras durante o Holoceno, entre 8.000 e 1.000 anos atrás (kaBP - mil anos antes do presente). A história populacional dos grupos construtores de sambaquis tem sido amplamente investigada por meio de marcadores culturais e bioantropológicos e, mais recentemente, por meio de estudos envolvendo DNA antigo. Até agora, as análises moleculares ainda não incluíram sambaquis costeiros do estado de São Paulo. Portanto, questões sobre a origem e a dispersão dos grupos de sambaqui na costa leste mais ao sul ainda permanecem em debate. Investigações iniciais obtiveram dados nucleares e mitocondriais de 20 indivíduos escavados do sambaqui costeiro de Piaçaguera, em São Paulo. Os materiais foram processados no Laboratório de Arqueogenética do Museu de Arqueologia e Etnologia da Universidade de São Paulo (para amostragem e extração de DNA) e no Instituto Max Planck de Antropologia Evolutiva (para amostragem, extração, indexação e sequenciamento). Resultados preliminares sugerem que a população do sambaqui de Piaçaguera está mais intimamente relacionada a grupos de sambaquis fluviais próximos do que a populações costeiras mais distantes. No entanto, o sequenciamento de DNA antigo na região ainda é escasso, devido principalmente à baixa preservação do material genético em ambientes tropicais. Com o objetivo de melhorar a resolução genômica nesses contextos, o projeto atual propõe o sequenciamento de indivíduos adicionais provenientes de sambaquis paulistas, visando uma compreensão mais ampla da dinâmica populacional local. Além disso, busca-se introduzir técnicas avançadas de preparação de bibliotecas moleculares, com foco na aplicação do protocolo de cadeia simples (Single-Stranded DNA Library Preparation), desenvolvido para otimizar a recuperação de DNA altamente degradado. Como essa metodologia ainda não está disponível na Universidade de São Paulo, o estágio no Instituto Max Planck representa uma oportunidade estratégica de capacitação e transferência de conhecimento técnico para o Brasil.