Desenvolvimento de Aplicações Computacionais para Análise de Dados em Projetos de Vigilância Viral e Vacinas de RNA

• Processo: 25/11113-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Rúbens Prince dos Santos Alves
• Beneficiário: Izabel de Geus Monteiro Gomes
• Instituição Sede: Institut Pasteur de São Paulo (IPSP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 24/03895-3 - Superando a Gripe com Vigilância Avançada em Águas Residuais e Desenvolvimento Acelerado de Vacinas de RNA replicativo, AP.JP
• Assunto(s): Águas residuárias Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: águas residuais | bioinformática | influenza A | Vacinas de RNA | vigilância genômic | Bioinformática

Resumo

Inserido na iniciativa "Outsmarting Influenza through Integrated Wastewater Surveillance and Rapid saRNA Vaccine Development", financiada pela FAPESP (Processo nº 24/03895-3) e conduzida sob a coordenação do Dr. Rúbens Prince dos Santos Alves, no Institut Pasteur de São Paulo, este projeto tem como objetivo desenvolver e aplicar soluções computacionais personalizadas para o tratamento, análise e visualização de dados laboratoriais gerados no contexto da vigilância genômica do IAV e do desenvolvimento de vacinas baseadas em saRNA. A investigação prioriza dados obtidos a partir de amostras de águas residuais, analisados por RT-qPCR, e sua integração com informações socioeconômicas, ambientais e clínicas. Essa abordagem visa apoiar decisões estratégicas em saúde pública, promovendo uma compreensão mais abrangente e contextualizada da circulação viral. A proposta contempla o mapeamento dos fluxos laboratoriais e o desenvolvimento de scripts e ferramentas de código aberto para o pré-processamento, normalização, visualização e organização automatizada de dados de RT-qPCR, em conformidade com as diretrizes MIQE, assim como a integração desses dados com outras bases. Ao final, espera-se estabelecer uma base de dados aberta e acessível, além de disponibilizar ferramentas reutilizáveis que acelerem a resposta a emergências sanitárias e fortaleçam a infraestrutura de vigilância genômica na cidade de São Paulo.