Identificação e análise de pequenos RNAs na rizosfera de Arabidopsis colonizada pelas bactérias da comunidade sintética SynCom35.

• Processo: 25/14900-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Fabio Tebaldi Silveira Nogueira
• Beneficiário: Mateus Henrique Vicente
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 25/00622-9 - Explorando o papel de microRNAs extracelulares no desenvolvimento vegetal e em interações com o microbioma da rizosfera., AP.R
• Assunto(s): Arabidopsis Microbiota
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arabidopsis | comunicação entre reinos | Microbioma | miRNAs extracelulares | MicroRNAs e regulação transcricional

Resumo

Pequenos RNAs extracelulares (sRNAs) têm se consolidado como importantes moléculas mediadoras das interações entre organismos distintos, incluindo plantas e microrganismos. No entanto, ainda se sabe pouco sobre quais sRNAs extracelulares participam dessas interações e como eles influenciam o desenvolvimento vegetal. Este estudo busca responder a duas questões centrais:(1) Como os sRNAs extracelulares - incluindo microRNAs (miRNAs) - podem modular o microbioma da rizosfera durante o desenvolvimento das plantas? (2) O microbioma da rizosfera pode regular a biogênese de sRNAs ao longo do desenvolvimento vegetal? Para isso, analisaremos o perfil transcriptômico de sRNAs em raízes de Arabidopsis thaliana colonizadas por uma comunidade sintética modelo composta por 35 membros (SynCom35), bem como os perfis taxonômicos do SynCom35 presentes nas raízes durante a transição dos estágios juvenil para adulto vegetativo em diferentes genótipos. Além disso, aplicaremos sRNAs/miRNAs exogenamente ao consórcio bacteriano SynCom35 com o objetivo de compreender seus papéis na composição da comunidade bacteriana e no impacto sobre o desenvolvimento radicular. Por fim, avaliaremos como a colonização bacteriana afeta a arquitetura radicular e modula a expressão de miRNAs nas plantas. Para cada um desses objetivos, empregaremos ferramentas de biologia molecular, genética do desenvolvimento, sequenciamento de nova geração (NGS) e bioinformática. (AU)