Bolsa de Doutorado Direto (DD) em Bioinformática aplicada à Transcriptômica e Genômica em ácaros (Fellowship DD)

• Processo: 25/05914-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2029
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Daniel Gonzalez Ibeas
• Beneficiário: Bruno Afonso Corrêa
• Instituição Sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 23/08989-3 - Análises bioinformáticas de RNAs codificantes e não codificantes em Brevipalpus yothersi e seu papel na interação com o vírus da Leprose dos citros C e na resposta a acaricidas, AP.JP
• Assunto(s): Acarologia Virologia Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: acarology | computational genomics | Transcriptomics | Virology | bioinformatica

Resumo

O gênero Brevipalpus (Acari: Tenuipalpidae) inclui mais de 300 espécies que estão entre as mais importantes pragas agrícolas. Elas infestam frutas cítricas, café e maracujá, três culturas relevantes no Brasil. Brevipalpus yothersi Baker é o principal vetor responsável pela transmissão do vírus da leprose dos citros C (CiLV-C). Os recursos genéticos deste organismo são essenciais para entender sua biologia, desenvolvimento e ciclo de vida, bem como para abordar os problemas que ele causa, por exemplo, para estudar as bases moleculares da interação ácaro-vírus ou a resistência contra acaricidas. As análises do transcriptoma permitem acessar o conteúdo do gene de um ponto de vista funcional. Embora as sequências codificadoras de proteínas tenham sido geralmente o centro da pesquisa, elas normalmente respondem por uma porcentagem menor de todo o espaço genético, e o estudo de tipos moleculares não codificadores tornou-se um complemento essencial. As técnicas de isolamento de RNA também permitem a caracterização de todo o conjunto de vírus de RNA presentes nos organismos, um aspecto fundamental para estudar a evolução do vírus e antecipar o surgimento de patógenos. O candidato terá a oportunidade de adquirir experiência sobre a biologia desta espécie de ácaro por meio de abordagens bioinformáticas para análise de genoma e transcriptoma de genes codificadores de proteínas, RNAs longos não codificantes, RNAs pequenos e composição do viroma.