CONSERVAÇÃO DE intraRNAs EM TRANSCRITOMAS DE PROCARIOTOS E TRADUÇÃO DE NOVAS ISOFORMAS PROTEICAS.

• Processo: 24/22076-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2025
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2029
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Tie Koide
• Beneficiário: Nathalia dos Santos Oliveira
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica comparativa Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: dRNA-seq | genômica comparativa | intraRNA | Procariotos | Tss | Bioinformática

Resumo

O mapeamento de inícios de transcrição (TSS - transcription start site) dos genes tem permitido uma compreensão mais detalhada da regulação gênica, seja na localização de promotores ou na identificação de isoformas de transcritos. A técnica de dRNAseq (differential RNA seq) tem sido utilizada em procariotos para realizar o mapeamento global de TSS, revelando diversas isoformas de transcritos. Uma das classes de transcritos ainda pouco explorada são os intraRNAs: RNAs com início de transcrição internos a genes codificadores de proteínas, localizados na mesma fita, e que podem ser traduzidos em isoformas proteicas. A tradução desses RNAs aumenta o repertório dos genomas procariotos compactos, ressaltando a modularidade dos domínios proteicos. Na literatura, observa-se casos interessantes de RNAs internos sobrepostos em bactérias e eucariotos. Porém, não foi realizado um estudo sistemático para entender a prevalência e conservação desses RNAs sobrepostos e a variedade de proteínas em diferentes organismos. Visto que há hoje uma grande quantidade de dados de início de transcrição, propomos neste projeto investigar a prevalência e conservação de intraRNAs em procariotos e seu impacto no potencial codificador do genoma. Além disso, serão realizadas buscas em banco de dados de géis bidimensionais e análises de dados de proteomas para identificação das isoformas proteicas em diferentes organismos. Baseado nos resultados obtidos, pretende-se escolher alvos em organismos específicos para estudos experimentais onde serão avaliadas a funcionalidade e importância dos intraRNAs e respectivas isoformas proteicas traduzidas. Desta forma, pretende-se contribuir para a compreensão do papel de transcritos sobrepostos no genoma na produção de novas proteínas em procariotos. (AU)