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Identificação de marcadores SNP e genes candidatos associados à produtividade e qualidade de semente em Urochloa humidicola através de uma abordagem molecular integrativa..

Processo: 25/17228-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2025
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2029
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Sofia Rengifo Del Aguila
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Empresa:Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Embrapa Sede
Vinculado ao auxílio:22/04006-2 - Centro de Melhoramento Molecular de Plantas (CeM²P), AP.PCPE
Assunto(s):Biologia computacional   Qualidade fisiológica de sementes   Transcriptômica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Associação genômica ampla (GWAS) | bioinformática | Gramineas forrageiras tropicais | Qualidade de sementes | Rendimento de sementes | Transcriptômica | Melhoramento Molecular de Plantas

Resumo

As gramíneas forrageiras tropicais têm uma importância fundamental para a pecuária brasileira, tanto para a alimentação do rebanho quanto para o mercado de sementes. A espécie Urochloa humidicola possui grande potencial devido à sua notável adaptabilidade e baixa exigência nutricional, posicionando-a como candidata ideal para a formação de pastagens em solos encharcados. Porém, sua produtividade de sementes é baixa em comparação com outras espécies do gênero. Essa característica, aliada ao curto período de retenção de sementes, à baixa porcentagem de sementes viáveis e à alta dormência, torna o processo de produção de sementes dessa espécie complexo, caro e desafiador. Nesse sentido, desvendar a arquitetura genética dos caracteres de produtividade e qualidade de sementes é essencial para o desenvolvimento de programas de melhoramento focados nesses atributos. O presente projeto propõe a integração de ferramentas moleculares de genômica e transcriptômica para identificar, pela primeira vez, regiões genômicas, genes candidatos e mecanismos moleculares associados a produtividades, vigor e germinação de sementes em U. humidicola. Para isso, será avaliado um painel de 179 acessos e híbridos diversos, todos os materiais disponíveis para a espécie, o qual será genotipado via GBS (Genotyping-by-Sequencing) e fenotipado para caracteres como produtividade total de sementes, produtividade de sementes puras, vigor e germinação. Posteriormente, será conduzido um estudo de associação genômica ampla (GWAS) para identificar loci e marcadores significativamente associados a essas características. Paralelamente, será realizada uma análise de RNA-Seq para comparar os transcriptomas dos genótipos mais contrastantes e identificar genes diferencialmente expressos. Espera-se que os resultados obtidos neste projeto sirvam como base para a implementação de técnicas modernas de melhoramento, como a Seleção Assistida por Marcadores (SAM), que podem acelerar o desenvolvimento de programas de melhoramento para U. humidicola, contribuindo assim para a produtividade e sustentabilidade da pecuária brasileira. (AU)

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