Identificação de marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) em regiões genômicas associados à regulação de degradação da clorofila em sementes de soja

• Processo: 22/11417-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2022
• Vigência (Término): 30 de abril de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Acordo de Cooperação: Organização Holandesa para a Pesquisa Científica (NWO)
• Pesquisador responsável: Edvaldo Aparecido Amaral da Silva
• Beneficiário: Rômulo Pedro Macêdo Lima
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agronômicas (FCA). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/50211-9 - Base genética e molecular da retenção de clorofila nas sementes: um passo à frente para melhorar a adaptabilidade da soja às mudanças climáticas, AP.TEM
• Assunto(s): Genômica Melhoramento genético Polimorfismo de um único nucleotídeo Estudo de associação genômica ampla Soja
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Gwas-Gbs | marcadores SNP | Semente verde | Soja | Genômica e Melhoramento Genético

Resumo

Os programas de melhoramento genético de soja têm como principais objetivos selecionar genótipos superiores associando a caracteres de interesse agronômico, como a qualidade das sementes e do óleo. Sabe-se que o "problema da semente verde" tem trazido graves danos às áreas agrícolas de soja no mundo particularmente devido às mudanças climáticas em curso. A eliminação deste problema se torna cada vez mais necessário pela soja ser uma grande cultura agrícola para produtos alimentícios, rações e biocombustíveis tanto no Brasil quanto no mundo, e o entendimento da base molecular para reduzir a retenção da clorofila em sementes maduras constitui num passo primordial. Desta forma, a identificação dos principais reguladores de degradação da clorofila em sementes de soja por meio da identificação de marcadores moleculares a serem usados na estratégia do melhoramento assistido e associados à característica da anomalia do esverdeamento, pode gerar dados promissores para que haja uma maior qualidade das sementes de soja. Nos últimos anos, o Laboratório de Sementes da Unesp/FCA (campus Botucatu) em parceria com a Wageningen University and Research e a Embrapa-Soja, têm acumulado conhecimento fundamental e aplicado sobre a retenção de clorofila nas sementes de soja, a partir de dados fisiológicos de avaliação da anomalia do esverdeamento em cultivares e linhagens de soja, bem como de parâmetros genéticos associados à esta característica. Assim, é importante aprofundar os estudos com genitores contrastantes e suas linhagens recombinantes para entender quais regiões genômicas poderiam estar envolvidas com a degradação da clorofila. No presente trabalho, uma abordagem GBS-GWAS (genotipagem por sequenciamento acoplada a estudos de associação genômica ampla) será utilizada em 156 genótipos de soja (dois parentais contrastantes e 154 linhagens endogâmicas recombinantes - RILs), usando dados prévios de qualidade fisiológica das sementes verdes e de sequenciamento genético de DNA desta população segregante. Desta forma, serão identificados marcadores SNP em regiões genômicas associadas à regulação de degradação da clorofila em sementes de soja, utilizando para tal a análise GWAS para validar estes marcadores SNP. O posicionamento de cada marcador SNP a ser encontrado no genoma de soja poderá identificar genes candidatos associados à regulação de degradação da clorofila em sementes para uso efetivo na seleção assistida por marcadores e na obtenção de plantas transgênicas mais tolerantes à retenção da clorofila. (AU)