Análises moleculares globais de células com superexpressão de circRNA do gene FMR1

• Processo: 25/09552-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Luciana Amaral Haddad
• Beneficiário: Daniel Key Takemoto
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de RNA Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Fmrp | Fmr1 | RNA-seq | Transcriptomics | Bioinformática

Resumo

A síndrome do X frágil é decorrente de mutações de perda de função no gene FMR1, quecodifica para a proteína FMRP, importante ao desenvolvimento do sistema nervoso central. Aexpressão do FMR1 deve ser finamente regulada aos níveis de RNAm e proteína para que acorticogênese cerebral ocorra sem alterações da neurogênese, migração neuronal ou plasticidadesináptica. Transcritos variáveis do FMR1 podem codificar para isoformas da FMRP ou regular aquantidade do RNAm deste gene. Em projeto anterior, identificou-se um RNA circular (circRNA)transcrito desse lócus cuja superexpressão na linhagem celular humana HEK293T aumentousignificativamente o total do RNAm linear, poliadenilado do FMR1. A sequência desse circRNA nãocodificador apresenta motivos e estruturas anteriormente caracterizados como elementos regulatóriosde RNA. Contudo, não se conhece como ele poderia regular quantitativamente o RNAm do FMR1ou outros RNAs. Neste projeto, temos a hipótese de que o circRNA do FMR1 junto a fatores emtrans regulem a quantidade de RNAm expresso por outros genes. O objetivo geral é desenvolverhipóteses de trabalho sobre o(s) mecanismo(s) de ação e possíveis efeitos funcionais do circRNA doFMR1, de modo baseado em evidências de análises globais de expressão gênica. O primeiro objetivoespecífico será analisar o transcriptoma de RNA poliadenilado de células transfectadas, cujos dadosorientarão à escolha de outras metodologias ômicas. A obtenção de dados significativos em modelode cultivo celular deverá abrir perspectivas para se avaliar os efeitos da superexpressão do circRNAem cérebro de camundongo.