Análisebioinformática dotranscriptomadecélulasúnicas dohipotálamo

• Processo: 25/15111-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Ronaldo de Carvalho Araújo
• Beneficiário: Natalia Bonetti Bertagna
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/14313-7 - Papel do sistema calicreina cininas no metabolismo e sua repercussão no exercício voluntário, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia molecular Hipotálamo Metabolismo Neurologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia molecular | Hipotálamo | metabolismo | neurologia

Resumo

ObolsistaserátreinadoparaeresponsávelporrealizaraanálisebioinformáticadosdadosdesequenciamentodoRNAdenúcleosúnicosdohipotálamo.Utilizaremosopipelinedocellrangeroferecidopela10xGenomicsparaprocessamentobásicodosdadosincluindodemultiplexação,alinhamento,filtragem,contagemdebarcodeseUMIs(uniquemolecularidentifiers), alémdereduçãodedimensionalidadedosclusters.Aanálisedosclusters serárealizadautilizandoaferramentaFindClustersdopacoteSeuratparaencontrarpotenciaisdiferençasnostiposeestadoscelularesdoscasosecontroles.Paraexplorarosaspectosmolecularesdascélulashipotalâmicasrealizaremosanálisedepseudotrajetória,deenriquecimentoparaverificaçãodegeneontology(GO),deviascelularesrelacionadasaosgenesencontradosutilizandoasbasesdedadosKyotoEncyclopediaofGenesandGenomes(KEEG),dereactoma e regulons.