Caracterização funcional de RNAs intrônicos não-codificadores expressos em câncer: efeito da inibição e super-expressão de ncRNAs intrônicos em linhagens tumorais humanas

• Processo: 09/14332-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2009
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sergio Verjovski Almeida
• Beneficiário: Ângela Aguirres Fachel
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 07/59168-7 - Caracterização funcional de RNAs intrônicos não-codificadores expressos no genoma humano, AP.TEM
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Caracterização Funcional | expressão gênica | ncRNAs | RNAi | RNAs intrônicos | super-expressão | Expressão gênica em eucariotos

Resumo

Evidências apontam que mais de 70% das bases do genoma humano são transcritas em RNAs, sendo que a maior parte deles não codifica para proteínas (ENCODE-Project-Consortium et al. 2007). As funções dos RNAs não-codificadores curtos, como microRNA e piRNA, estão sendo estudadas por vários grupos de pesquisa (O'Donnell and Boeke 2007; Amaral et al. 2008; Louro et al. 2009). Entretanto, pouca atenção tem sido dada à caracterização funcional dos transcritos não-codificadores longos, inclusive os expressos a partir de íntrons de genes codificadores para proteínas. Embora na literatura exista alguns trabalhos que descrevem o envolvimento de ncRNAs na regulação gênica, como o RNA intrônico (Saf) antissenso do gene Fas na regulação de splicing alternativo no mesmo locus (Yan et al. 2005) e o trabalho que descreve modificações globais no perfil de expressão gênica após superexpressão de seqüências intrônicas do gene CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) (Hill et al. 2006), a função exercida pelos mais de 55.000 RNAs não-codificadores (ncRNAs) que são transcritos nos íntrons de 74% de todos os genes presentes no genoma humano (Nakaya et al. 2007) permanece desconhecida. Durante o desenvolvimento do projeto temático nos anos 2002-2008, identificamos vários grupos de transcritos intrônicos, potencialmente envolvidos em câncer, e iniciamos a sua caracterização funcional. Obtivemos resultados promissores, mostrando que vários transcritos intrônicos estão envolvidos na regulação de proliferação celular. O objetivo do presente projeto é estudar os mecanismos de atuação e envolvimento em câncer dos transcritos intrônicos, usando como modelo as linhagens tumorais submetidas à depleção ou superexpressão de ncRNAs intrônicos. (AU)