Data mining e análise de expressão in vivo de famílias de genes preditos de Moniliophthora perniciosa

• Processo: 08/53797-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
• Beneficiário: Taís Sineiro Herig
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Mineração de dados Predição de genes Genomas Expressão gênica Basidiomycota Moniliophthora perniciosa Doenças de plantas Vassoura-de-bruxa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Basidiomicetos | Bioinformatica | Data Mining | Expressao Genica | Moniliophthora Perniciosa | Predicao Genica

Resumo

O agente etiológico da doença vassoura-de-bruxa, que afeta o cacaueiro, é o fungo Moniliophthora perniciosa. Devido às perdas na produção de cacau com o aparecimento dessa doença e à importância econômica do cacau para o Brasil, o projeto genoma de M. perniciosa está em andamento a fim de viabilizar possíveis obtenções de métodos que contenham a vassoura-de-bruxa. M. perniciosa é um fungo hemibiotrófico por apresentar dois estágios distintos em seu ciclo de vida - biotrófico e necrotrófico - e está classificado filogeneticamente no grupo dos fungos basidiomicetos e ao lado de Moniliophthora roreri, outro fungo patógeno de plantas, causador da moniliase do cacau. A partir do sequenciamento do genoma de M. perniciosa, estudos começaram a ser feitos para identificação de genes ainda não descritos do fungo. Assim, através de programas específicos de predição gênica foram obtidas famílias gênicas formadas por genes preditos que têm similaridade com proteínas hipotéticas de organismos basidiomicetos. Além disso, foram obtidas famílias gênicas que não têm similaridade com M. roreri, Este projeto consta do estudo de duas famílias de genes preditos, para que partindo de análises de bioinformática - cura e anotação - seja estabelecido o conjunto de membros pertencentes a essas famílias que serão analisados in vivo através de análises de Real-Time PCR. (AU)