Sequenciamento completo e caracterizacao do padrao de expressao de novos genes humanos.

• Processo: 02/13876-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2003
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2004
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Dirce Maria Carraro
• Beneficiário: Elisa Napolitano e Ferreira
• Instituição Sede: Hospital A C Camargo. Fundação Antonio Prudente (FAP). São Paulo , SP, Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Catalogo Genico Humano

Resumo

A identificação de todos os genes de um genoma é importante, porque somente com a definição completa do catálogo gênico entenderemos como um organismo funciona. Na área médica, a identificação de todos os genes correlacionados com diferentes patologias é indispensável para a compreensão e o entendimento das bases bioquímicas, facilitando diagnóstico, prevenção e tratamento. Existem basicamente duas abordagens distintas para identificar genes em larga escala: o seqüenciamento de clones de DNA genômico, seguido de identificação gênica por ferramentas computacionais; e o seqüenciamento de clones de cDNA, que representa a porção transcrita do genoma. Porém, devido à complexidade da estrutura genômica os programas computacionais podem geram predições falsas necessitando assim, de comprovações experimentais. Nesse trabalho utilizaremos duas abordagens distintas com o objetivo de identificar novos transcritos humanos e caracterizar sua estrutura. As abordagens serão: seleção de clones que representam genes ainda não caracterizados provindos de biblioteca de cDNA com alta diversidade de transcritos, e também a utilização de ortólogos de camundongos, baseada em alinhamento e desenho de primers a partir da seqüência genômica. Os novos transcritos selecionados serão seqüenciados completamente e caracterizados quanto ao padrão de expressão. A partir de suposta seqüência de aminoácidos serão identificados os domínios protéicos. (AU)