Análise comparativa de bancos de genes através de recursos da bioinformática para identificação de ESTs de cana-de-açúcar envolvidos na resistência a nematóides

• Processo: 01/06074-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2003
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Carlos Augusto Colombo
• Beneficiário: Guilherme Gomes Baptista
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Resistência à doença Biologia computacional Etiquetas de sequências expressas Nematoides Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Cana De Acucar | Ests | Genbank | Nematoides | Resistencia A Doencas

Resumo

Os nematóides parasitas de plantas são patógenos que causam perdas anuais da ordem de 100 bilhões de dólares à agricultura mundial. Estudos mostraram que Meloidogyne javanica e Pratylenchus zeae, isoladamente, podem reduzir a produtividade de cana-de-açúcar em cerca de 50%. Ao longo do tempo, as plantas e seus patógenos estabeleceram uma relação particular de co-evolução, com o aparecimento de mecanismos sofisticados de defesa das plantas, como a reação de hipersensibilidade, produção de fitoalexinas, enzimas hidrolíticas como quitinase e glucase, deposição de calose, lignina e glicoproteínas ricas em hidroxíprolinas na parede celular, etc. A identificação destes genes nas plantas tornou-se uma estratégia importante na luta contra os parasitos de plantas, atualmente bastante favorecida pelos vários projetos de sequenciamento que se encontram em andamento, a exemplo dos atualmente apoiados pela FAPESP (Xylella fastidiosa, Cana-de-açúcar, Xanthomonas, AEG e Humano do Câncer). Nesse sentido, a proposta deste projeto é identificar genes potencialmente relacionados com a resistência a nematóides, através de análise computacional e pesquisa de similaridade com seqüências disponíveis de genes semelhantes ou relacionados com a resistência a nematóides já descritos para outras espécies e disponíveis em bancos de dados internacionais e o banco de genes de cana-de-açúcar do SUCEST. (AU)