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FORESTs: Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium

Processo: 01/10251-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE
Vigência: 01 de novembro de 2001 - 31 de outubro de 2004
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Recursos Florestais e Engenharia Florestal - Silvicultura
Pesquisador responsável:Helaine Carrer
Beneficiário:Helaine Carrer
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Empresa: Consórcio de Empresas Florestais de Papel e Celulose
Município: Piracicaba
Assunto(s):Biologia computacional  Genômica  Análise de sequência de DNA  Eucalipto 

Resumo

O projeto Genoma Eucalipto visou identificar 15 mil genes por meio do sequenciamento de aproximadamente 100 mil ESTs (Expressed Sequence Tags), preparadas a partir de bibliotecas de diferentes tecidos, incluindo plântulas, folhas, raízes, caule e madeira. As sequências de ESTs foram anotadas automaticamente e clusterizadas para a identificação dos genes. Por meio do uso de tecnologias de bioinformática, o projeto realizou a análise dessas sequências, observando a redundância durante o sequenciamento; a comparação (Blast) das sequências com as depositadas em bancos de dados internacionais e do programa Genoma FAPESP; e a clusterização das sequências obtidas por programas especiais de análise de dados, como CAP3 e outros. Adicionalmente, pretendeu-se usar as informações obtidas para realizar a análise da expressão gênica usando os microarrays. Com isso, buscou-se desenvolver uma nova tecnologia de identificação de genes envolvidos no controle genético da qualidade da madeira e na resistência a doenças e pragas, estresses ambientais e tolerância a deficiências nutricionais. A intenção era que essas informações fossem disponibilizadas rapidamente às empresas para modificação das propriedades da madeira no uso industrial ou em outras aplicações. (AU)

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