Estudo dos genes nucleares de paracoccidioides brasiliensis relacionadas a atividade da atp sintase da membrana interna da mitocondria.

• Processo: 02/00384-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2002
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Francisco Gorgônio Nóbrega
• Beneficiário: Tatiana de Moura Pereira
• Instituição Sede: Instituto de Pesquisa e Desenvolvimento (IP&D). Universidade do Vale do Paraíba (UNIVAP). São José dos Campos , SP, Brasil
• Assunto(s): Mitocôndrias Paracoccidioides brasiliensis Mineração de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Atp Sintase | Data Mining | Genes Nucleares | Mitocondria | Paracoccidioides Brasiliensis

Resumo

1 Varrer o banco de dados de projeto colaborativo (c/ Dr.-G.H. Goldman) de Paracocciodioides brasiliensis usando algoritmo de busca de similaridade para identificar os genes putativos candidatos a serem homólogos dos genes S. cerevisiae relacionados à função da ATP sintase. 2 Analisar cuidadosamente a seqüências encontradas quanto à extensão e posicionamento dos alinhamentos, número de identidades e similaridades, valor do "score" e de E-value, anotando os possíveis cDNAs que aparentemente trazem o gene completo e nestes casos analisar a extremidade N-terminal das proteínas derivadas para caracterizar a presença do peptídeo do endereçamento para a mitocôndria. 3 Completar o seqüenciamento dos cDNAs completos com qualidade e fazer a análise comparativa dos polipeptídeos potencialmente codificados por alinhamento com as proteínas similares já descritas em outros organismos para obter informação filogenéticamente válida. 4 Tentar a complementação funcional em levedura de um dos cDNAs completos identificados. (AU)