Estudo das interacoes e propriedades fisico-quimicas envolvidas na complexacao proteica: uma abordagem mesoscopica por monte carlo

• Processo: 08/57216-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Fernando Luis Barroso da Silva
• Beneficiário: André Azevedo Reis Teixeira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Interações eletrostáticas Simulação de dinâmica molecular Muramidase Método de Monte Carlo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coeficiente De Virial | Hamaker | Interacoes Eletrostaticas | Lisozima | Monte Carlo | Simulacao Molecular

Resumo

Estudos in silico se tomaram uma ferramenta de destaque nas áreas de Ciências Farmacêuticas, Bioquímica, Biofísica e Biologia Molecular. A necessidade do entendimento quantitativo de fenômenos macroscópicos exige estudos mais detalhados, geralmente ao nível molecular, os quais são possíveis de serem realizados com o emprego de simulações computacionais. Nossa proposta é estudar o efeito de diferentes parâmetros físico-químicos envolvidos na complexação do sistema lisozima-lisozima. A abordagem será através de simulações Monte Cario baseadas em modelos mesoscópicos com solvente implícito. Diferentes Hamiltonianas serão empregadas: (a) puramente eletrostáticas, e (b) combinando interações eletrostáticas com van der Waals. Estaremos investigando os efeitos de regulação de carga (por pH), de concentração de sal e correlação íon-íon. Nossas principais ferramentas de análise serão derivadas da energia livre e comparações com resultados experimentais. (AU)