Estudos Estruturais Experimentais e Teóricos com Proteínas/Fatores de Transcrição Envolvidos no Metabolismo de Glicogênio do Fungo Neurospora crassa

• Processo: 10/00789-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Marcos Roberto de Mattos Fontes
• Beneficiário: Angelo José Magro
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/57566-8 - O fungo filamentoso Neurospora crassa como um organismo modelo para a identificação e caracterização de novas proteínas/fatores de transcrição regulando o metabolismo de glicogênio, AP.TEM
• Assunto(s): Neurospora crassa Biologia computacional Biologia estrutural Cristalografia de proteínas Fatores de transcrição
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Cristalografia de Proteínas | fatores de transcrição | metabolismo de glicogênio | Neurospora crassa | Biologia Molecular Estrutural

Resumo

O sequenciamento de genomas vem permitindo que estudos regulatórios possam ser realizados mais profundamente. Nas células vivas, genomas não são constituídos apenas de DNA, mas também de uma grande quantidade de proteínas que dinamicamente interagem com o DNA e modulam a expressão gênica. Utilizando técnicas bioquímicas acopladas à espectrometria de massas nosso laboratório identificou algumas proteínas capazes de ligar ao promotor gsn que codifica a enzima glicogênio sintase de Neurospora crassa, regulatória do processo de síntese de glicogênio. Além disso, utilizando um banco de linhagens do fungo individualmente mutadas nos genes que codificam fatores de transcrição, várias proteínas foram identificadas como envolvidas na regulação do metabolismo do carboidrato, tanto no crescimento normal do fungo quanto na situação de estresse térmico. Alguns dos fatores de transcrição identificados apresentam ortólogos funcionais depositados em banco de dados e outros foram anotados como proteínas hipotéticas ou predicted proteins. Considerando os resultados obtidos, nossos principais objetivos neste projeto são: 1) investigar como as proteínas/fatores de transcrição com funções biológicas já conhecidas atuam na regulação do metabolismo de glicogênio empregando diferentes abordagens experimentais, 2) empregar técnicas de biologia estrutural para tentar atribuir uma função biológica às proteínas identificadas e anotadas como proteínas hipotéticas ou predicted, 3) realizar estudos de caracterização bioquímica, tais como identificar proteínas parceiras e de localização celular das proteínas mais promissoras do ponto de vista regulatório, 4) investigar se as alterações na regulação do metabolismo do carboidrato podem estar correlacionadas com modificações na estrutura da cromatina. Com este projeto esperamos contribuir de forma efetiva para gerar informações relevantes do ponto de vista de regulação da expressão gênica em microrganismos.