Caracterizacao funcional dos cofatores do exossomo de saccharomyces cerevisaes e de pyrococcus.

• Processo: 06/56504-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Juliana Silva da Luz
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Processamento de RNA Exossomos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Exossomo | Processamento De Rna | Rnase

Resumo

O exossomo é um complexo de 11 exoribonucleases 3'-5'em eucariotos, envolvido na maturação de rRNAs, snRNAs e snoRNAs, e degradação de RNAs presentes tanto no núcleo quanto no citoplasma. A estrutura do exossomo de archaea (a-exossomo) foi determinada recentemente e análise de seqüência, somada aos dados de duplo híbrido e co-purificação de complexos protéicos, sugerem um modelo para o complexo de levedura. Contudo, ainda não foi possível determinar à existência de subunidades regulatórias do complexo, assim como, a função dos cofatores que interagem de forma transiente com o exossomo. Nosso laboratório tem se dedicado à caracterização da atividade e estrutura das proteínas do exossomo de Saccharomyces cerevisiae e de Pyrococcus. Nestes organismos a atividade é dependente da formação do dímero de RNases PH e são necessários ao menos 5 nucleotídeos para atingir o sítio ativo das RNases, o que sugere que uma das formas de regulação do complexo está na presença de estruturas secundárias nos substratos. Por isso nosso objetivo agora é investigar a participação de alguns dos cofatores transientes sobre a atividade do exossomo e verificar se esta é processiva ou distributiva, hidrolítica ou fosforolítica, utilizando diferentes RNAs como substratos e identificar os produtos gerados. (AU)