SMOLBNET2: estudo de estrutura de proteínas componentes e reguladoras do exossomo de Archaea e de levedura

• Processo: 10/51842-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Carla Columbano de Oliveira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Nilson Ivo Tonin Zanchin
• Auxílio(s) vinculado(s): 12/21016-0 - Visita a laboratórios do IQ e do IB da USP, para estabelecer colaborações nas áreas de biologia de sistemas e análise de interações entre proteínas, para possibilitar o intercâmbio de estudantes de pós-graduação entre USP e Univ. Warwick, e para participação na SBBq, AV.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/05776-2 - Caracterização funcional de Nop53/PICT1: modulação da biogênese ribossomal, atividade do exossomo, e efeito sobre o ciclo celular, BP.DD; 14/04628-7 - Análise do papel de cofatores do exossomo na expressão e estabilidade da exoribonuclease RRP6 em Saccharomyces cerevisiae, BP.IC; 12/50196-6 - Caracterização bioquímica e estrutural das interações do exossomo de levedura com proteínas reguladoras com proteínas reguladoras de sua atividade, BP.PD; 11/50604-4 - Caracterizacao bioquimica e estrutural das interacoes da proteina rrp43 com outras subunidades do exossomos de levedura., BP.PD; 11/04073-7 - Aspectos genéticos do glaucoma primário de ângulo aberto (gpaa) na população brasileira, BP.DR
• Assunto(s): Química orgânica Proteínas Leveduras
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Molecular Estrutural | Controle De Expressao Genica | Cristalografia | Exossomo | Microscopia Eletronica | Processamento De Rna

Resumo

Em eucariotos, vários eventos de processamento pós-transcricional são necessários para a síntese de RNAs maduros. RNAs mensageiros (mRNAs), de transferência (tRNAs), e ribossomais (rRNAs), assim como snRNAs (small nuclear) e snoRNAs (small nucleolar), são processados através de várias etapas que envolvem reações específicas entre RNAs e proteínas. Embora a maioria dos fatores seja específica para cada via maturação dos diferentes tipos de RNAs, alguns são comuns a todos esses eventos. Dentre os fatores comuns está o exossomo, um complexo formado por onze subunidades em Saccharomyces cerevisiae e humanos, que apresenta atividade exoribonucleolítica 3'→5' e que está envolvido na maturação de rRNAs, snoRNAs, snRNAs e na degradação de todos os tipos de RNAs, inclusive na via de RNAi. Nosso laboratório tem-se concentrado no estudo de controle pós-transcricional de expressão gênica, através da caracterização funcional e estrutural de proteínas envolvidas em processamento e degradação de RNAs. Determinamos anteriormente a estrutura do complexo do exossomo na archaea Pyrococcus a partir de dados de espalhamento de raios X a baixo ângulo (Ramos et al., 2006), e cristalografia (Navarro et al., 2008). Obtivemos um modelo da arquitetura do complexo em eucariotos a partir de dados de interação entre as subunidades do exossomo de levedura (Luz et al., 2007). Estudamos também fatores reguladores do exossomo em levedura e em Pyrococcus abyssi (Granato et al., 2008; Luz et al., 2010). Este trabalho tem como objetivo principal a continuação do estudo funcional e estrutural do exossomo de archaea e de levedura e de outras proteínas que interagem com este complexo. (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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