Dynamic shape analysis

• Processo: 02/02504-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2002
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Luciano da Fontoura Costa
• Beneficiário: Marconi Soares Barbosa
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/12765-2 - Desenvolvimento e avaliação de métodos originais e precisos em análise de formas e imagens e visão computacional, AP.TEM
• Assunto(s): Cálculo de variações Visão computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biological Shapes | Deconvolution | Dynamic Shapes | Shape Analysis | Variational Calculus

Resumo

This work addresses the problem of analyzing the evolution of shape over time in certain biological systems. This is an important problem in the field of developmental biology and we wish to build on previous work in the group on related problems and apply some of these techniques to it. In particular, our research will initially focus on the geometrical characteristics of neurons and on the analysis of the changing shape of these cells. Using data at our disposal, our goal is to develop models for the geometrical evolution of these cells and then to provide verification of these models through extensive simulation. The considered approaches include the estimation of differential geometry measures such as normal and tangent field, and curvature, as well as variational and deconvolution models (possibly non-stationary in time and space). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

COSTA, L. DA F.; BARBOSA, M. S.; MANOEL, E. T. M.; STREICHER, J.; MÜLLER, G. B.. Mathematical characterization of three-dimensional gene expression patterns. Bioinformatics, v. 20, n. 11, p. 1653-1662, Jul. 2004. (02/02504-1, 99/12765-2)

RODRIGUES‚ E.P.; BARBOSA‚ M.S.; COSTA‚ L.F.. Self-referred approach to lacunarity. Physical Review E, v. 72, n. 1, p. 016707, 2005. (99/12765-2, 03/02789-9, 02/02504-1)

COSTA, L. DA F.; COUPEZ, V.; BARBOSA, M. S.. A direct approach to neuronal connectivity. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS, v. 341, n. 1-2, p. 618-628, Oct. 2004. (96/05497-3, 02/02504-1, 99/12765-2)