Candidatus Liberibacter spp.: sequenciamento parcial do genoma e transcriptoma de plantas de laranja doce com sintomas de HLB (Huanglongbing ou greening)

• Processo: 07/02796-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2007
• Data de Término da vigência: 04 de agosto de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marcos Antonio Machado
• Beneficiário: Eliane Cristina Locali
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Bactérias Expressão gênica Caracterização molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bacteria | Caracterização Molecular | expressão gênica | microarrays | Genômica estrutural e funcional

Resumo

A ocorrência de inúmeras pragas e doenças associadas ao plantio em áreas não irrigadas são alguns dos fatores que explicam a baixa produtividade da citricultura paulista. Entre as doenças destacam-se a clorose variegada dos citros (CVC), o cancro cítrico a leprose, a morte súbita e, mais recentemente, o huanglongbing (ex-greening), considerada a mais grave e destrutiva das doenças de citros, e é causada pela bactéria Gram-negativa, limitada ao floema – Candidatus Liberibacter spp. É uma doença há muito tempo conhecida na Ásia e África, porém foi relatada oficialmente no Brasil (Araraquara-SP) em julho de 2004 e em 2005 na Flórida – EUA. A bactéria pode ser transmitida através de material vegetal contaminado (borbulhas), ou naturalmente através de vetor (Diaphorina citri), ou ainda experimentalmente por cipó chumbo (Cuscuta campestris). Nas plantas de citros, a presença da bactéria resulta em sintomas muitas vezes confundidos com problemas nutricionais. Todas as variedades copa de laranja doce, tangerinas e híbridos inter ou intra-específicos do gênero Citrus são suscetíveis. Visando ampliar os conhecimentos genômicos sobre a bactéria (uma vez que as informações disponíveis atuais restringem-se a poucos genes ribossomais) e ao patossistema do HLB, este trabalho tem por objetivos: 1. sequenciar regiões genômicas de Candidatus Liberibacter spp; 2. avaliar através de micro arranjos de DNA genes diferencialmente expressos em plantas de laranja doce infectadas ou não com a bactéria; 3. validar, por RT-qPCR, o conjunto de genes que mais poderiam estar associados a resposta da planta à infecção.