Análise de estruturas conformacionais de complexos de DNA e RNA homopoliméricos

• Processo: 06/55317-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2007
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Eduardo Gorab
• Beneficiário: Laura Silveira Drummond Moreira
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Heterocromatina Cromossomos Rhynchosciara Conformação proteica Polinucleotídeos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Conformacao | Cromossomo | Heterocromatina | Hibrido Dna-Rna | Homopolimero | Rhynchosciara

Resumo

Polinucleotídeos sintéticos têm sido empregados na formação de complexos de ácidos nucléicos de interesse para o estudo das propriedades das diferentes conformações destes complexos. Duplas ou triplas hélices podem ser formadas por DNA, RNAou também moléculas hibridas contendo os dois tipos de ácidos nucléicos. Um procedimento alternativo de detecção da dupla hélice híbrida DNA-RNA envolve o uso de sondas de RNA não marcado e de um anticorpo que reconhece especificamente a conformação hibrida DNA-RNA. Seu emprego na detecção de hibridação com sondas de polinucleotídeos sintéticos em cromossomos politênicos de dípteros revelou que RNA poli-A híbrida em regiões cromossômicas discretas de espécies de Rhynchosciara (Diptera: Sciaridae), indicando a existência de regiões genômicas anormalmente enriquecidas em DNA homopolimérico dA/dT. Entretanto, RNA poli-U foi incapaz de reproduzir os resultados obtidos com a sonda de poli-rA nestas espécies. O objetivo do projeto será o de desenvolver metodologias de análise da formação e detecção de complexos entre DNA e RNA homopoliméricos em preparações cromossômicas, em géis de agarose e em membranas. Estas técnicas visarão compreender o fenômeno da impossibilidade de detecção da conformação de dupla hélice híbrida DNA-RNA quando RNAs homopoliméricos de composição específica são empregados na formação de complexos com DNA. (AU)