Paracoccidioides brasiliensis: sequenciamento de clones genomicos completos i.

• Processo: 05/59184-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marina Pasetto Nobrega
• Beneficiário: Ana Paula Rodrigues dos Santos
• Instituição Sede: Instituto de Pesquisa e Desenvolvimento (IP&D). Universidade do Vale do Paraíba (UNIVAP). São José dos Campos , SP, Brasil
• Assunto(s): Clonagem Íntrons
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Clonagem Molecular | Genoma Nuclear | Introns

Resumo

Paracoccidioides brasiliensis (PB) é um fungo termodimórfico responsável pela paracoccidioidomicose (PCM). O nosso grupo iniciou o estudo do genoma deste organismo examinando cerca de 7.000 segmentos aleatórios do genoma nuclear de PB, oriundos de clones pequenos (1,5 a 6,5 kb) e neste projeto pretende ampliar a busca de genes nucleares com a construção de, bibliotecas com clones contendo insertos grandes (7 a 40 kb). Neste estudo pretendemos estudar a organização do genoma nuclear deste fungo, seqüenciado inteiramente um mínimo de dois (02) clones com insertos grandes (40Kb). Paralelamente das centenas de clones já obtidos com insertos grandes, vamos gerar as seqüências das extremidades 5'e 3' de maneira a enriquecer nosso banco de dados de RSTs (seqüências genômicas aleatórias). O outro aspecto central deste projeto é educacional: pretendemos desenvolver o estudo com equipes de quatro estudantes atuando simultaneamente, cada uma analisando clones individuais, instruídos e supervisionados por membros "senior" do laboratório. Os vários aspectos da abordagem necessários para o sucesso do projeto vão transmitir aos estudantes envolvida aprendizagem direta e ativa de clonagem molecular, mapeamento de restrição, sequenciamento de DNA, bioinformática da montagem e finalização de uma seqüência genômica, identificação de genes e introns e anotação criteriosa de genes identificados. (AU)