Estudo da evolução intraespecífica de Candida parapsilosis por máxima verossimilhança

• Processo: 01/12979-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2002
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marcelo Ribeiro da Silva Briones
• Beneficiário: Ana Carolina Barbosa Padovan
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Filogenia Evolução molecular Análise de sequência de RNA Candida parapsilosis Técnica de amplificação ao acaso de DNA polimórfico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Candida Parapsilosis | Evolucao Molecular | Tipagem

Resumo

C. parapsilosis é a 2ª espécie mais encontrada em candidemias no Brasil e 3 grupos distintos foram identificados por tipagens moleculares. Os objetivos deste projeto são: (a) verificar se a diversidade observada por RAPD entre os três grupos corresponde à distâncias genéticas estimadas por comparação de sequências de DNA; (b) inferir a filogenia de máxima verossimilhança dos grupos de C. parapsilosis entre as leveduras da ordem Saccharomycetales; (c) estimar os tempos de divergência entre as espécies de leveduras pertencentes a esta ordem, utilizando os genes rRNA 18S com a taxa de evolução deste gene recalibrada para os ascomicetos por um registro fóssil de um fungo ascomiceto de 400 milhões de anos; (d) verificar se as filogenias apresentam congruência e se existe correlação entre a evolução do grupo e as diferentes características epidemiológicas das linhagens. Para isso, a candidata sequenciará o gene rRNA 18S, a região espaçadora interna transcrita 1 (ITS1) e as bandas obtidas por RAPD com padrão de presença ou ausência diferente entre os grupos, para investigar regiões do genoma de maior divergência. A candidata alinhará as sequências de rRNA 18S deste projeto junto a sequências de outras espécies de fungos e inferirá a melhor filogenia do grupo por testes de razão de verossimilhança. A taxa de evolução do gene rRNA 18S será recalibrada utilizando máxima verossimilhança com relógio molecular e com a datação do registro fóssil. (AU)