Parallel data mining in genetic databases

• Processo: 00/10660-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Matemática da Computação
• Pesquisador responsável: Junior Barrera
• Beneficiário: Martha Ximena Torres Delgado
• Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Identificação de sistemas Processamento paralelo Mineração de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Data Mining | Identificacao De Sistemas | Processamento Paralelo

Resumo

The large amounts of data stored in genetic databases represent an important challenge in order to understand and to analyze many biological processes. Therefore, it is essential to explore data mining techniques for data analysis. In several cases, these demand a high computational power and data processing. Hence, parallel processing on data mining emerges as an alternative in order to improve the performance. This project is interested in to explore parallel algorithms for two data mining problems: identification of Lattice Dynamical Systems, that are applied for modeling gene expression networks and learning of stochastic grammars for homology discovery. Since these demand a high computational power. This project would improve the performance of an information management system for analysis of gene expression, which is being developed within the CAGE (Cooperation for Analysis of Gene Expression) Project financed by FAPESP. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MARTHA TORRES; JUNIOR BARRERA. A parallel algorithm for finding small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 27, n. 4, p. 686-690, 2004-00-00. (00/10660-8)