Proteoma da xylella fastidiosa: estrategia para comprovar a expressao de genes potencialmente envolvidos na patogenicidade.

• Processo: 00/04031-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2000
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2003
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: José Camillo Novello
• Beneficiário: Daniel Martins-de-Souza
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Proteoma Genomas Biologia computacional Xylella fastidiosa Eletroforese
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Eletroforese | Genoma | Patogencidade | Proteoma | Xylella Fastidiosa

Resumo

Em projetos Proteoma, a estratégia convencional é analisar o "spot" de interesse e depois identificar a ORF relacionada, seguindo assim o sentido Proteoma - Genoma. Porém, quando um gene de interesse já é conhecido, seria interessante percorrer o sentido contrário, isto é, com a seqüência do gene de interesse em mãos, determinar o "spot" correspondente. Além de comprovar a expressão do gene, seria possível quantificar o nível de expressão e analisar como modula sua expressão em diferentes condições. Para isso, foi idealizada uma estratégia chamada de estratégia GP (Genoma - Proteoma): os genes de interesse teriam o pl e o MW (peso molecular) teórico calculados, a suas prováveis regiões de localização no mapa de referência 2D determinadas. Estas regiões indicariam os "spots" a serem analisados por sequenciamento N-terminal a fim de confirmar o N-terminal do gene de interesse e, assim, sua expressão. O objetivo de presente projeto é analisar o potencial da estratégia GP utilizando como modelo genes da Xylella fastidiosa anotados na classe patogênica. (AU)