Otimização de protocolo para amplificação de marcadores microssatélites e análise da diversidade genética em inhame (Dioscorea cayennensis Lam.)

• Processo: 07/01581-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Elizabeth Ann Veasey
• Beneficiário: Gustavo Henrique Recchia
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética ecológica Repetições de microssatélites Amplificação do DNA Diversidade genética Dioscorea Inhame Vale do Ribeira (SP)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: agricultura tradicional | Dioscorea cayenensis | Diversidade Genética | Microssatélites | protocolo | Vale do Ribeira | Genética Ecológica

Resumo

Este trabalho visa otimizar as condições de amplificação e revelação de marcadores microssatélites, bem como avaliar a diversidade genética de 17 acessos (etnovariedades) de inhame (Dioscorea cayenensis Lam.) coletadas em sistemas agrícolas autóctones do Vale do Ribeira (SP), nos municípios de Cananéia, Iguape, Iporanga e Eldorado. Para a extração do DNA será testado o método de Elias et al. (2004), baseado no tampão de extração CTAB, com modificações. Serão também testadas as condições de amplificação e revelação de 13 iniciadores para a avaliação dos 17 acessos desta espécie. Por ser uma espécie poliplóide, os dados serão genotipados como presença e ausência (+/-) e assim submetidos à análise de variância (AMOVA) utilizando o programa Arlequin (Schneider et al., 2000). Serão também realizadas análises de agrupamento, utilizando o coeficiente de Jaccard e o método aglomerativo UPGMA (Alfenas, 1998), a partir do software NTSYS-pc (Rohlf, 1992), e uma análise de componentes principais, pelo software SAS for windows.