Otimização de protocolo para amplificação de marcadores microssatélites e análise da diversidade genética em inhame (Dioscorea trifida L.)

• Processo: 07/00845-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Elizabeth Ann Veasey
• Beneficiário: Aline Borges
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética ecológica Diversidade genética Repetições de microssatélites Dioscorea Inhame
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Agricultura Tradicional | Dioscorea Trifida | Diversidade Genetica | Microssatelites | Protocolo | Variedades Tradicionais | Genética Ecológica

Resumo

Este estudo visa otimizar as condições de amplificação e revelação de marcadores microssatélites, e avaliar a diversidade genética de 22 acessos (etnovariedades e variedades comerciais) de inhame (Dioscorea trifida) coletadas em sistemas agrícolas autóctones do Vale do Ribeira (SP), nos municípios de Cananéia e Iguape, assim como em comunidades tradicionais e mercado da Amazônia e aldeia indígena no Estado do Mato Grosso. Para a extração de DNA, será testado o método de Elias et al. (2004), baseado no tampão de extração CTAB, com modificações. Serão também testadas as condições de amplificação e revelação de 11 iniciadores para a avaliação dos 22 acessos desta espécie. Por ser uma espécie poliplóide, os dados serão genotipados como presença ou ausência (+/-) e assim submetidos à análise de variância (AMOVA) utilizando o programa Arlequin. Serão também realizadas análises de agrupamento, utilizando o coeficiente de Jaccard e o método aglomerativo UPGMA, a partir do software NTSYS-pc, e uma análise de componentes principais, pelo software SAS for windows.