Determinacao de protocolo para extracao de dna, quantificacao e avaliacao da diversidade genetica em batata-doce [ipomoea batatas (l.) lam.] utilizando-se marcadores de microssatelites.

• Processo: 04/08359-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2005
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Elizabeth Ann Veasey
• Beneficiário: Mariana Silva Rosa
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Batata-doce Repetições de microssatélites Vale do Ribeira (SP) Protocolo Diversidade genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Batata-Doce | Diversidade Genetica | Ipomoea Batatas (L.) Lam. | Microssatelites | Protocolo | Vale Do Ribeira

Resumo

Este trabalho visa estabelecer o protocolo para a extração e quantificação de DNA e avaliação da diversidade genética de 12 etnovariedades de batata-doce [Ipomoea batatas (L.) Lam.] coletadas em sistemas agrícolas autóctones do Vale do Ribeira, por meio de marcadores moleculares de microssatélites. Esta técnica se baseia na amplificação de regiões conhecidas do DNA genômico, os quais se apresentam em localizações diferentes do genoma. A amplificação é feita através da reação do DNA com primers, em condições específicas de temperatura. Será testada uma metodologia de extração de DNA já descrita na literatura, específica para a cultura da batata-doce. Caso esta não apresente resultados satisfatórios, será testado um protocolo já estabelecido na literatura para mandioca. As demais etapas serão também realizadas de acordo com a literatura, testando-se oito primers estabelecidos para batata-doce, e otimizando-se as condições de amplificação de bandas de microssatélites nas reações de PgR. Serão utilizadas colorações com nitrato de prata e gel de poliacrilamida, tanto para a quantificação como para a revelação das bandas de microssatélites. Estando otimizado o protocolo, serão avaliadas 12 etnovariedades de batata-doce coletadas no Vale do Ribeira, SP. (AU)