Estudos cristalográficos do inibidor de proteinases extraído das sementes de Copaifera langsdorffii

• Processo: 99/04497-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 1999
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2003
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica
• Pesquisador responsável: Igor Polikarpov
• Beneficiário: Sandra Krauchenco
• Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Copaifera langsdorffii Cristalografia de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Copaifera Langsdorffii | Inibidor De Proteases | Inibidores Tipo Bowman-Birk

Resumo

O inibidor de proteases já foi extraído de Copaifera langsdorffii e já foi feito um tratamento prévio de extração e purificação desse inibidor. Foi feito um screening inicial com os kits I e II sendo que pequenos cristais foram obtidos em algumas condições. Será feito um refinamento das condições para se obter cristais nativos de melhores tamanhos e qualidade. Dados de difração de raios X desses cristais serão coletados na linha de cristalografia de proteínas (Polikarpov et al.) no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS, Campinas, Brasil) e esses dados serão processados com os programas DENZO e SCALEPACK (Otwinowski, 1993). Será feita substituição molecular com o programa AmoRe (Navaza, 1994) usando modelos cristalográficos dos inibidores do tipo Bowman-Birk existentes e disponíveis no PDB. O modelo inicial será refinado utilizando-se o programa REFMAC do conjunto de programas CCP4 (Collaborative Computacional Project, no. 4,1994) e analisado com o uso do programa O. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

KRAUCHENCO‚ S.; NAGEM‚ R.A.P.; DA SILVA‚ J.A.; MARANGONI‚ S.; POLIKARPOV‚ I.. Three-dimensional structure of an unusual Kunitz (STI) type trypsin inhibitor from Copaifera langsdorffii. Biochimie, v. 86, n. 3, p. 167-172, 2004. (99/03387-4, 00/02317-1, 99/04497-8)